Здравствуй, Хабр! Разработка ингибиторов мутантного онкобелка KRAS ( особенно формы G12D)- одна из главных задач современной онкофармакологии. Используя наш проприетарный матаппарат мы рассчитали несколько секвенсов под целевой карман мишени. Мы оперировали секвенсами от 7 до 21 остатка на мишенях длиной от 102 до 188 остатков, полученные при докинге результаты ipTM в AlfaFold Server варьировались от 0.58 до 0.92.
Читать далее
Фолдинг белка на ноутбуке. De novo дизайн KRAS G12D (Switch II) ингибитора. Докинг, валидация в AlfaFold Server и PyMOL
Source: geektimes